負責研究所全面工作。主要負責發展戰略規劃、科技布局與科技創新、重大改革、學科建設、重大成果、重大項目、人才隊伍、重大政務、財務與資產。具體分管財務資產處,聯系森林生態與林業生態工程中心Email:jiaojunzhu@iae.ac.cn
負責黨委工作。分工負責黨建、人事、研究生教育、離退休工作。具體分管黨群辦、人事教育處。Email:cjjin@iae.ac.cn
負責科研平臺、科技開發、院地合作、國際合作與交流、科學傳播、知識產權管理。協助所長負責戰略規劃、科技布局、學科建設、重大項目、重大成果。具體分管科技處(科研平臺、院地合作、國際合作、知識產權、科學普及)、公共技術服務中心、分析測試中心,聯系土壤生態與農業生態工程中心。Email:fangyt@iae.ac.cn
負責紀委工作、工會和職代會工作。協助黨委書記負責日常黨務工作、協助所長負責日常所務工作。分工負責紀檢監察審計、工會和職代會、科研道德與學風建設、制度建設、創新文化、宣傳工作、政務信息、綜合檔案,以及省市協調工作。具體分管黨群辦(監察審計室、工會)、綜合辦公室(政務信息、檔案管理)。Email:xhao@iae.ac.cn
負責科研計劃、成果管理、安全保衛保密、園區建設與后勤保障、編輯出版、網絡文獻信息,協助所長負責財務與資產工作、戰略規劃、科技布局、學科建設、重大項目、重大成果。具體分管綜合辦公室(安全、保密、基建、后勤)、科技處(科研計劃、科研項目、科研成果、網絡文獻信息)、編輯部,協管財務資產處,聯系污染生態與環境生態工程中心。Email:zhuojc@iae.ac.cn