研究中心
森林生態與林業生態工程研究中心前身是1954年建所時設立的林業室。本中心以森林和草地生態系統為主要研究對象，研究生態系統生物多樣性與生產力的維持機制，闡釋生態系統尺度碳、氮、水循環及其耦合機制，揭示土壤-植被-大氣連續體中水分與營養物質傳輸過程及動力學機制，為生態系統服務功能提升與科學經營提供理論與技術支撐。中心現有學科組15個，職工65人，其中研究員30人，國家杰出青年基金獲得者1人，優秀青年基金獲得者5人。
土壤生態與農業生態工程研究中心的前身是1954年設立的土壤室和1955年設立的農化室。本中心面向我國現代農業發展和土地保護的重大科技需求，以東北農田生態系統和草地生態系統等為主要研究對象，重點開展黑土地保護技術與原理、土壤養分循環過程及調控機制、土壤供肥與作物吸肥規律的生物學機制、新型綠色肥料研發技術、生態系統結構與功能維持機理、多營養級生物多樣性及互作關系等方面的研究工作。中心現有學科組15個，職工100余人，其中研究員28人、國家級人才計劃獲得者6人。
污染生態與生態環境工程中心前身是1981成立的污染生態學研究室，是我國最早開展土壤-植物系統污染生態學研究的單位。本中心主要面向陸地生態系統與區域可持續發展，圍繞國際環境科學前沿問題以及國家戰略需求，重點研究污染生態過程、環境毒理學、生態修復與污染治理等領域的基礎理論與技術方法，并在有毒有害污染物的生態過程及毒理效應、污染土壤修復與污染場地治理、水體污染控制與水質改善、固體廢棄物處理與資源化利用等領域取得了若干創新性成果?，F有9個研究組、38名科研人員，其中研究員14人，國家杰出青年基金獲得者1人。
